Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm6880A3KG45 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm6880A3KG45 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6880A3KG45 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6880A3KG45 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6880A3KG45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6880A3KG45 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms