Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp8b5A3FIN4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b5A3FIN4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b5A3FIN4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b5A3FIN4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b5A3FIN4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp8b5A3FIN4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atp8b5A3FIN4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp8b5A3FIN4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b5A3FIN4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8b5A3FIN4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp8b5A3FIN4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b5A3FIN4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp8b5A3FIN4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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