Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r232A2RTT5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r232A2RTT5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r232A2RTT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vmn1r232A2RTT5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r232A2RTT5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r232A2RTT5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r232A2RTT5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms