Protein–RNA interactions for Protein: A2BDP1

Fam155b, Transmembrane protein FAM155B, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam155bA2BDP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam155bA2BDP1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam155bA2BDP1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam155bA2BDP1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam155bA2BDP1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam155bA2BDP1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam155bA2BDP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam155bA2BDP1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam155bA2BDP1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms