Protein–RNA interactions for Protein: A2ACJ2

Faap100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap100A2ACJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Faap100A2ACJ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Faap100A2ACJ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Faap100A2ACJ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Faap100A2ACJ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Faap100A2ACJ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Faap100A2ACJ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Faap100A2ACJ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Faap100A2ACJ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Faap100A2ACJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Faap100A2ACJ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Faap100A2ACJ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms