Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef6A2A8M8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef6A2A8M8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef6A2A8M8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramef6A2A8M8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef6A2A8M8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms