Protein–RNA interactions for Protein: A0A1Y7VIU7

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1Y7VIU7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1Y7VIU7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1Y7VIU7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1Y7VIU7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1Y7VIU7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1Y7VIU7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1Y7VIU7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1Y7VIU7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1Y7VIU7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1Y7VIU7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1Y7VIU7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1Y7VIU7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1Y7VIU7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1Y7VIU7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1Y7VIU7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.1 ms