Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup205A0A0J9YUD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup205A0A0J9YUD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup205A0A0J9YUD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup205A0A0J9YUD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup205A0A0J9YUD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup205A0A0J9YUD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup205A0A0J9YUD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup205A0A0J9YUD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup205A0A0J9YUD5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup205A0A0J9YUD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup205A0A0J9YUD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup205A0A0J9YUD5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup205A0A0J9YUD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms