Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r82A0A087WRV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r82A0A087WRV1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r82A0A087WRV1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r82A0A087WRV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms