Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trbc2A0A075B5J4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbc2A0A075B5J4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trbc2A0A075B5J4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trbc2A0A075B5J4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trbc2A0A075B5J4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trbc2A0A075B5J4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbc2A0A075B5J4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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