Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Q7

Mrpl45, 39S ribosomal protein L45, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl45Q9D0Q7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl45Q9D0Q7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl45Q9D0Q7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms