Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk4Q8VEJ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms