Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nsun3Q8CCT7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nsun3Q8CCT7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nsun3Q8CCT7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nsun3Q8CCT7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nsun3Q8CCT7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsun3Q8CCT7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsun3Q8CCT7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms