Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psme1P97371 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psme1P97371 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psme1P97371 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psme1P97371 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Psme1P97371 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms