Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms