Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prf1P10820 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prf1P10820 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prf1P10820 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms