Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rabep1O35551 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rabep1O35551 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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