Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smad7O35253 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad7O35253 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms