Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Smad7O35253 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smad7O35253 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Smad7O35253 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Smad7O35253 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Smad7O35253 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smad7O35253 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smad7O35253 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smad7O35253 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Smad7O35253 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smad7O35253 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smad7O35253 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smad7O35253 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smad7O35253 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smad7O35253 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smad7O35253 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smad7O35253 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smad7O35253 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smad7O35253 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smad7O35253 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smad7O35253 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Smad7O35253 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smad7O35253 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smad7O35253 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smad7O35253 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smad7O35253 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smad7O35253 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad7O35253 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad7O35253 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smad7O35253 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad7O35253 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad7O35253 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad7O35253 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad7O35253 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smad7O35253 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smad7O35253 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smad7O35253 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad7O35253 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smad7O35253 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smad7O35253 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smad7O35253 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad7O35253 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad7O35253 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad7O35253 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad7O35253 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad7O35253 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad7O35253 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad7O35253 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad7O35253 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smad7O35253 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad7O35253 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad7O35253 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad7O35253 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad7O35253 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad7O35253 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad7O35253 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad7O35253 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad7O35253 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad7O35253 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad7O35253 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smad7O35253 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad7O35253 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad7O35253 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad7O35253 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad7O35253 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad7O35253 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad7O35253 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad7O35253 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad7O35253 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smad7O35253 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad7O35253 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad7O35253 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smad7O35253 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad7O35253 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad7O35253 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad7O35253 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad7O35253 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad7O35253 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad7O35253 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smad7O35253 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad7O35253 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad7O35253 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad7O35253 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad7O35253 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad7O35253 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad7O35253 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad7O35253 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad7O35253 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad7O35253 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad7O35253 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad7O35253 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad7O35253 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad7O35253 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad7O35253 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad7O35253 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad7O35253 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad7O35253 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad7O35253 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad7O35253 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad7O35253 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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