Protein–RNA interactions for Protein: A2ADA5

Pusl1, tRNA pseudouridine synthase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pusl1A2ADA5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pusl1A2ADA5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pusl1A2ADA5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms