Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NumbQ9QZS3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NumbQ9QZS3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms