Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpc1Q9QZF2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms