Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Cldn19Q9ET38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Cldn19Q9ET38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Cldn19Q9ET38 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Cldn19Q9ET38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Cldn19Q9ET38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Cldn19Q9ET38 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Cldn19Q9ET38 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn19Q9ET38 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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