Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933402E13RikQ9D4D2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms