Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc30Q8BVF4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.3 ms