Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
U2surpQ6NV83 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2surpQ6NV83 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms