Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg9aQ68FE2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms