Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms