Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nkain3Q3URJ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nkain3Q3URJ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nkain3Q3URJ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nkain3Q3URJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nkain3Q3URJ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nkain3Q3URJ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkain3Q3URJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms