Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf6Q3TWW8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf6Q3TWW8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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