Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2mP61082 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2mP61082 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms