Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acvr1P37172 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acvr1P37172 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms