Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhoP15409 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhoP15409 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhoP15409 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhoP15409 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhoP15409 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhoP15409 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhoP15409 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhoP15409 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhoP15409 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhoP15409 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhoP15409 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhoP15409 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms