Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efna3O08545 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efna3O08545 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna3O08545 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.1 ms