Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc1Q9QZF2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms