Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spns3Q9D232 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Spns3Q9D232 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spns3Q9D232 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms