Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Zbtb40Q6PCS8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbtb40Q6PCS8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms