Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc10Q3TLI0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc10Q3TLI0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms