Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2f6O54917 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2f6O54917 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2f6O54917 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f6O54917 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f6O54917 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f6O54917 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f6O54917 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms