Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd4A2AKM2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd4A2AKM2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms