Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubl3Q9Z2M6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms