Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atad1Q9D5T0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atad1Q9D5T0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms