Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
OxsmQ9D404 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OxsmQ9D404 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms