Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan11Q9D1D1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms