Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsnaxip1Q99P25 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms