Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc30Q8BVF4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc30Q8BVF4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms