Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcl3Q8BVF2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcl3Q8BVF2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms