Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc8a1P70414 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms