Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhoP15409 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RhoP15409 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RhoP15409 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RhoP15409 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RhoP15409 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RhoP15409 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RhoP15409 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RhoP15409 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms