Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vamp4O70480 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vamp4O70480 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp4O70480 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms